# Data Wrangling and Automated Reports from 'SIVIGILA' Source

## Documentation for package ‘sivirep’ version 1.0.1

- DESCRIPTION file.
- User guides, package vignettes and other documentation.
- Package NEWS.

## Help Pages

agrupar_area_geo | Agrupar por área geográfica
agrupar_cols_casos | Agrupar por columnas y casos
agrupar_dpto | Agrupar por departamento y casos
agrupar_edad | Agrupar por edad y casos
agrupar_edad_sex | Agrupar por edades, sexo y casos
agrupar_eventos | Agrupar por tipo de enfermedad o evento
agrupar_fecha_inisintomas | Agrupar por fecha de inicio de síntomas y casos
agrupar_mpio | Agrupar por municipios y casos
agrupar_per_etn | Agrupar por la pertenencia étnica
agrupar_rango_edad | Agrupar por rango de edad y casos
agrupar_semanaepi | Agrupar por semana epidemiológica y casos
agrupar_sex | Agrupar por sexo y casos
agrupar_sex_semanaepi | Agrupar por sexo, semana epidemiológica y casos
agrupar_tipo_caso | Agrupar por la clasificación inicial del caso
agrupar_top_area_geo | Agrupar por área geográfica a nivel departamental o municipal
agrupar_years | Agrupar por años de una enfermedad o evento
calcular_incidencia | Calcular incidencia
calcular_incidencia_geo | Calcular incidencia según distribución geográfica
calcular_incidencia_sex | Calcular incidencia por sexo
convert_edad | Convertir edad a años
dengue2020 | Datos Dengue 2020 del SIVIGILA en sivirep
divipoladata | Códigos e información geografica del DIVIPOLA en sivirep
estandarizar_geo_cods | Estandarizar códigos geográficos de los datos de una enfermedad o evento
geo_filtro | Filtrar por departamentos y municipios
import_data_event | Importar los datos de una enfermedad o evento por año desde los microdatos del SIVIGILA
import_geo_cods | Importar datos geográficos de Colombia
import_pob_incidencia | Importar la población para efectuar el cálculo de la incidencia
import_pob_proyecciones | Importar las proyecciones DANE del año 2005 hasta el 2035
import_pob_riesgo | Importar la población a riesgo de un evento o enfermedad
limpiar_data_sivigila | Limpiar datos de SIVIGILA
limpiar_edad_event | Limpiar las edades de los datos de una enfermedad o evento
limpiar_encabezado | Limpiar las etiquetas del encabezado
limpiar_fecha_event | Limpiar fechas de los datos de una enfermedad o evento
limpiar_val_atipic | Limpiar los valores atípicos de los datos
list_events | Importar enfermedades y años disponibles para su descarga desde los microdatos del SIVIGILA
obtener_cond_inciden_event | Obtener las condiciones para calcular la incidencia de una enfermedad o evento
obtener_dptos | Obtener departamentos de Colombia
obtener_fila_mas_casos | Obtener la fila con mayor número de casos
obtener_info_depts | Obtener información geográfica de los datos de la enfermedad o evento
obtener_meses_mas_casos | Obtener los meses con mayor número de casos
obtener_nombre_dpto | Obtener el nombre de un departamento de Colombia
obtener_nombre_mpio | Obtener el nombre de un municipio de Colombia
obtener_text_sex | Obtener el párrafo de la distribución de casos por sexo
obtener_tip_ocurren_geo | Obtener columnas de ocurrencia geográfica de los datos de la enfermedad o evento
obtener_val_config | Obtener valor del archivo de configuración
plot_area_geo | Generar gráfico de distribución de casos por área geográfica
plot_dptos | Generar gráfico de distribución de casos por departamentos
plot_edad | Generar gráfico de distribución de casos por edad
plot_edad_sex | Generar gráfico de distribución de casos por edad y sexo
plot_fecha_inisintomas | Generar gráfico de distribución de casos por fecha de inicio de síntomas
plot_map | Generar mapa
plot_mpios | Generar gráfico de distribución de casos por municipios
plot_per_etn | Generar gráfico de distribución de casos por pertenencia étnica
plot_sex | Generar gráfico de distribución de casos por sexo
plot_sex_semanaepi | Generar gráfico de distribución de casos por sexo y semana epidemiológica
plot_tabla_incidencia_geo | Generar tabla con la incidencia
plot_tabla_incidencia_sex | Generar tabla con la incidencia por sexo
plot_tabla_tipos_event | Generar tabla con la distribución de casos por tipo de enfermedad o evento
plot_tipo_caso | Generar gráfico de distribución de casos por la clasificación inicial del caso
plot_tipo_caso_years | Generar gráfico de distribución de casos por la clasificación inicial del caso y los años seleccionados
plot_top_area_geo | Generar gráfico de distribución de casos por área geográfica a nivel departamental o municipal
plot_years | Generar gráfico de distribución de casos por año